2023年4月，为深化落实国家卫生健康委办公厅《关于印发内镜诊疗技术应用管理规定及呼吸内镜诊疗技术13个内镜诊疗技术临床应用管理规范的通知》有关要求，助推《“十四五”国家临床专科能力建设规划》落地见效，进一步加强我国医疗机构内镜诊疗技术临床应用管理，规范儿科呼吸内镜诊疗技术临床应用行为，保障医疗质量和安全，国家卫生健康委人才交流中心组建了儿科呼吸内镜医师培训项目专家委员会，在全国遴选了49家单位作为儿科呼吸内镜医师培训协作单位，开展儿科呼吸内镜医师培训相关工作。儿科呼吸内镜医师培训项目旨在提高儿科呼吸内镜技术的诊疗水平，推广高水平儿科呼吸内镜医师和专科护士的培养，以更好地满足儿童呼吸内科的医疗需求。
2022年11月9日，新疆维吾尔自治区人力资源和社会保障厅发布《关于公布自治区2022年第一批新设立博士后科研工作站和博士后创新实践基地单位名单的通知》（新人社函〔2022〕219号）。我院获批设立博士后创新实践基地。
2022年5月31日，是第8个“世界遗尿日”。这一天，中国医师协会儿科分会肾脏病专家委员会授牌“儿童遗尿诊治定点单位”，北京儿童医院新疆医院正式为儿童遗尿门诊挂牌。
2021年10月28日，第六届全国杰出专业技术人才表彰会在北京举行。会上，中央组织部、中央宣传部、人力资源社会保障部、科技部联合表彰了93名全国杰出专业技术人才和97个全国专业技术人才先进集体。北京儿童医院新疆医院新生儿内科位列其中，荣获“全国专业技术人才先进集体”称号。
2021年9月，新疆维吾尔自治区科学技术厅陆续发布自治区科技计划项目的立项通知，新疆维吾尔自治区儿童医院获批省级科技计划项目共计6项，财政资助科研经费总额达108万元。这是自治区儿童医院首次以第一承担单位获批省级科技援疆计划项目及自然科学基金（杰出青年科学基金项目）。
2021年6月4日上午，新疆维吾尔自治区儿童医院召开自治区危重新生儿救治中心授牌仪式大会。新疆维吾尔自治区卫生健康委为自治区儿童医院危重新生儿救治中心授牌。这意味着，自治区儿童医院正式加入了自治区危重新生儿救治的行列。
2021年6月4日上午，新疆维吾尔自治区儿童医院召开自治区危重新生儿救治中心授牌仪式大会。新疆维吾尔自治区卫生健康委为自治区儿童医院危重新生儿救治中心授牌。这意味着，自治区儿童医院正式加入了自治区危重新生儿救治的行列。
2021年5月，自治区人民政府公布了“2020年度自治区科学技术奖获奖科技成果和突出贡献奖”
2021年4月17日，《中华小儿外科杂志》第十届编委会换届会议暨第一次工作会议在重庆隆重举行。新疆维吾尔自治区儿童医院党委委员、副院长李水学连任该杂志编委，也是连续第4年担任该杂志编委。
2021年1月20日，新疆维吾尔自治区抗击新冠肺炎疫情表彰大会在新疆人民会堂隆重举行。新疆维吾尔自治区儿童医院9人荣获“自治区抗击新冠肺炎疫情先进个人”称号，3人获“自治区优秀共产党员”称号，2个集体荣获“自治区抗击新冠肺炎疫情先进集体”荣誉称号。
2021年1月10日，由国家卫生健康委医政医管局和健康报社联合举办的2020年改善医疗服务典型经验交流总结大会召开，凭借着在改善医疗服务中的诸多创举，北京儿童医院新疆医院在全国医院中“突出重围”，斩获2020年度改善医疗服务3项大奖：医院荣获“2020年度改善医疗服务示范医院”，副院长罗新辉获“2020年度改善医疗服务突出贡献工作者”，医院小儿普通外科荣获“2020年度改善医疗服务示范科室”。
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